| 科目名 | : | 生命物理化学実習 |
|---|---|---|
| 英文名 | : | Practice in Physical Chemistry for Life Sciences |
| 科目概要 | : | 薬・創薬, ２年, 後期, 必修, 1単位 A, B, C, D, S, 集中３・４・５限 |
| 科目責任者 | : | 志鷹 真由子 (生物分子設計学・教授) |
| 担当者 | : | 志鷹 真由子 (生物分子設計学・教授), 下山 紘充 (生物分子設計学・助教), 清田 泰臣 (生物分子設計学・助教) |
| 備考 | : | 〔科目ナンバリング：PP304-PC02, PL304-PC02〕 |
コンピュータを用いてタンパク質構造を解析するために、基本的なバイオインフォマティクス技術を修得する。また、薬学における物理化学を理解するために、屈折率測定法や凝固点測定法などの物理的試験法の操作法を修得する。
この科目は学位授与方針（ディプロマ・ポリシー）の薬学科④、生命創薬科学科③に関連する。
「バイオインフォマティクス分野」と「物理化学分野」の2つの分野に関して、実習・演習を行う。
実習書、パワーポイント、配付資料などを用いて方法を説明したのち、実技を行う。グループワークを行う。問題演習を行う。
| No. | 実習項目 | 担当者 | 到達目標・学習方法・内容 | SBO |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ガイダンス | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | 生命物理化学実習の概要を理解する。 | |
| 2 | バイオインフォマティクス① | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | LINUX OS でファイル処理等の基本操作を行えるようになる。 ※SBO Adv-C6-⑤-2 | |
| 3 | バイオインフォマティクス② | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | タンパク質のモチーフを理解する。PROSITE の検索システムを使ってモチーフ検索を行い、結果を解釈できるようになる。 ※SBO Adv-C6-④-3 | |
| 4 | バイオインフォマティクス③ | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | ホモロジー検索を理解する。BLAST によるホモロジー検索を行い、結果を解釈できるようになる。 ※SBO Adv-C6-⑧-6 | |
| 5 | バイオインフォマティクス④ | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | タンパク質立体構造の基礎を理解する。コンピュータを用いてタンパク質立体構造を観察できるようになる。 ※SBO Adv-C6-④-3 | |
| 6 | 屈折率測定 | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | 屈折率測定の原理及び操作法を修得し、屈折率を測定できるようになる。 | |
| 7 | 凝固点降下測定① | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | 凝固点降下測定の原理及び操作法を修得し、凝固点を測定できるようになる。 | |
| 8 | 凝固点降下測定② | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | 凝固点降下測定の原理及び操作法を修得し、凝固点を測定できるようになる。 | |
| 9 | 物理化学演習 | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | 物理化学に関する演習問題が解けるようになる。 | |
| 10 | 試験 | 志鷹 真由子 下山 紘充 清田 泰臣 | 生命物理化学実習に関する基本的な問題が解ける。さらに、応用問題にも対応できる。 |
| C1 | 1 | 3 | 4 | 光の屈折、偏光、および旋光性について説明できる。 |
| C1 | 2 | 6 | 1 | 希薄溶液の束一的性質について説明できる。 |
| C1 | 1 | 3 | 4 | 光の屈折、偏光、および旋光性について説明できる。 |
| C1 | 2 | 6 | 1 | 希薄溶液の束一的性質について説明できる。 |
| C1 | 2 | 6 | 1 | 希薄溶液の束一的性質について説明できる。 |
| C1 | 2 | 1 | 1 | ファンデルワールスの状態方程式について説明できる。 |
| C1 | 2 | 1 | 2 | 気体の分子運動とエネルギーの関係について説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 1 | 熱力学における系、外界、境界について説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 2 | 熱力学第一法則を説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 3 | 状態関数と経路関数の違いを説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 4 | 定圧過程、定容過程、等温過程、断熱過程を説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 5 | 定容熱容量および定圧熱容量について説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 6 | エンタルピーについて説明できる。 |
| C1 | 2 | 2 | 7 | 化学変化に伴うエンタルピー変化について説明できる。 |
| C1 | 2 | 3 | 1 | エントロピーについて説明できる。 |
| C1 | 2 | 3 | 2 | 熱力学第二法則について説明できる。 |
| C1 | 2 | 3 | 3 | 熱力学第三法則について説明できる。 |
| C1 | 2 | 3 | 4 | ギブズエネルギーについて説明できる。 |
| C1 | 2 | 3 | 5 | 熱力学関数を使い、自発的な変化の方向と程度を予測できる。 |
| C1 | 1 | 3 | 4 | 光の屈折、偏光、および旋光性について説明できる。 |
| C1 | 2 | 1 | ||
| C1 | 2 | 2 | ||
| C1 | 2 | 3 | ||
| C1 | 2 | 6 | 1 | 希薄溶液の束一的性質について説明できる。 |
| 定期試験 | |
| 授業 | |
| その他 | 実習態度（50%）と試験成績（50%）により評価します。 無断欠席・遅刻・早退などは減点対象となります。 |
本実習では、「バイオインフォマティクス分野」と「物理化学分野」の2つの分野の実習を行います。
どちらの分野も、積極的な態度で実習に臨んでください。
わからない点があれば、質問に来てください。
| 1 | 【授業時間外に必要な学習の時間：- 時間】 |
| 2 | 予習として実習書、教科書をよく読んでください。 復習として前回までの実習内容の理解を深め、次回の実習に備えてください。 |
| 種別 | 書名 | 著者・編者 | 発行所 |
|---|---|---|---|
| 教科書 | 生命物理化学実習書 | 生物分子設計学教室 | 北里大学薬学部 |
| 教科書 | ライフサイエンスのための物理化学 | JAMERS R. BARRANTE 著 清水博、山本晴彦、桐野豊 訳 | 東京化学同人 |
| 参考書 | （なし） |