Web Syllabus(講義概要)
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科目名:創薬情報科学特論
英文名:Special Lectures on Information Science for Drug Discovery
科目概要:修士_薬科専_薬科コ, 修士課程2年・修士課程1年, 前期, 必修, 2単位
火曜日2時限, 3301講義室
科目責任者:志鷹 真由子 (生物分子設計学・教授)
担当者:志鷹 真由子(生物分子設計学・教授)田中 信忠(創薬物理化学・教授)山乙 教之(創薬物理化学・准教授)清田 泰臣(生物分子設計学・講師)小澤 新一郎(創薬物理化学・助教)中込 泉(創薬物理化学・助教)吉田 智喜(創薬物理化学・助教)若杉 昌輝(生物分子設計学・助教)大田 雅照※(非常勤教員)安達 成彦(特別講師)石原 正章(特別講師)
備考:

授業の目的

近年、創薬研究において、コンピュータの活用はますます重要になってきている。そこで、修士課程における研究を実施するために、薬学研究におけるコンピュータの活用に関する基本的知識を学習する。
この科目は学位授与方針(ディプロマ・ポリシー)の薬科学専攻修士課程②⑤に関連する。

教育内容

バイオインフォマティクス、ケモインフォマティクス、構造生物学、合理的薬物設計などについて講義する。

教育方法

パワーポイントと配付資料などを活用しながら、講義形式ですすめる。講義内容の理解を深めるために、演習課題などに取り組ませる。講義で生じた疑問点については速やかにコメントする。
対面授業にて実施する。

講義内容

No.講義項目担当者開講日到達目標・学習方法・内容
1タンパク質構造情報と創薬1:創薬研究におけるStructure-Based Drug Designとin silico技術大田 雅照
4月8日②標的タンパク質の立体構造を利用した創薬研究について理解し、説明できる。
2タンパク質構造情報と創薬2:コンピュータを用いたタンパク質立体構造予測清田 泰臣
4月15日②タンパク質立体予測の役割と重要性を理解し、説明できる。
3タンパク質構造情報と創薬3:人工知能技術の創薬への応用大田 雅照
4月22日②創薬研究における人工知能技術の役割と重要性について理解し、説明できる。
4タンパク質構造情報と創薬4:Chemoinformatics概説若杉 昌輝
5月13日②化学構造情報をコンピュータ上でどのように取り扱うか理解し、説明できる。
5タンパク質構造情報と創薬5:タンパク質の分子シミュレーション清田 泰臣
5月20日②タンパク質の分子シミュレーションの役割と重要性を理解し、説明できる。
6タンパク質構造情報と創薬6:まとめ志鷹 真由子
5月27日②創薬研究におけるコンピュータの活用の重要性を理解し、説明できる。
7X線結晶構造解析法を用いたタンパク質の立体構造解析の概説
※教室変更:1507セミナー室
田中 信忠
6月3日②タンパク質の立体構造解析におけるX線結晶構造解析法の役割や重要性を理解し、説明できる。
8電子実験ノートの利用とその応用
※教室変更:1507セミナー室
石原 正章
6月10日②実験ノートの重要性並びに現在の電子化の潮流とその利点を理解し、説明できる。
9NMR法を用いたタンパク質の立体構造解析の概説
※教室変更:1507セミナー室
小澤 新一郎
6月17日②タンパク質の立体構造解析におけるNMR法の役割や重要性を理解し、説明できる。
10クライオ電子顕微鏡法を用いたタンパク質の立体構造解析の概説
※教室変更:1507セミナー室
安達 成彦
6月24日②タンパク質の立体構造解析におけるクライオ電子顕微鏡法の役割や重要性を理解し、説明できる。
11In silico Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
田中 信忠
7月1日②In silico Drug Design全般に関して要点を説明できる。
12Ligand-Based Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
中込 泉
7月8日②Ligand-Based Drug Designについて要点を説明できる。
13Structure-Based Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
吉田 智喜
7月15日②Structure-Based Drug Designについて要点を説明できる。
14Fragment-Based Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
小澤 新一郎
7月22日②Fragment-Based Drug Designについて要点を説明できる。
15Structure-Based Drug Designのまとめ
※教室変更:1507セミナー室
山乙 教之
7月29日②Structure-Based Drug Designの実例を理解できる。
No. 1
講義項目
タンパク質構造情報と創薬1:創薬研究におけるStructure-Based Drug Designとin silico技術
担当者
大田 雅照
開講日
2025-04-08
到達目標・学習方法・内容
標的タンパク質の立体構造を利用した創薬研究について理解し、説明できる。
No. 2
講義項目
タンパク質構造情報と創薬2:コンピュータを用いたタンパク質立体構造予測
担当者
清田 泰臣
開講日
2025-04-15
到達目標・学習方法・内容
タンパク質立体予測の役割と重要性を理解し、説明できる。
No. 3
講義項目
タンパク質構造情報と創薬3:人工知能技術の創薬への応用
担当者
大田 雅照
開講日
2025-04-22
到達目標・学習方法・内容
創薬研究における人工知能技術の役割と重要性について理解し、説明できる。
No. 4
講義項目
タンパク質構造情報と創薬4:Chemoinformatics概説
担当者
若杉 昌輝
開講日
2025-05-13
到達目標・学習方法・内容
化学構造情報をコンピュータ上でどのように取り扱うか理解し、説明できる。
No. 5
講義項目
タンパク質構造情報と創薬5:タンパク質の分子シミュレーション
担当者
清田 泰臣
開講日
2025-05-20
到達目標・学習方法・内容
タンパク質の分子シミュレーションの役割と重要性を理解し、説明できる。
No. 6
講義項目
タンパク質構造情報と創薬6:まとめ
担当者
志鷹 真由子
開講日
2025-05-27
到達目標・学習方法・内容
創薬研究におけるコンピュータの活用の重要性を理解し、説明できる。
No. 7
講義項目
X線結晶構造解析法を用いたタンパク質の立体構造解析の概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
田中 信忠
開講日
2025-06-03
到達目標・学習方法・内容
タンパク質の立体構造解析におけるX線結晶構造解析法の役割や重要性を理解し、説明できる。
No. 8
講義項目
電子実験ノートの利用とその応用
※教室変更:1507セミナー室
担当者
石原 正章
開講日
2025-06-10
到達目標・学習方法・内容
実験ノートの重要性並びに現在の電子化の潮流とその利点を理解し、説明できる。
No. 9
講義項目
NMR法を用いたタンパク質の立体構造解析の概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
小澤 新一郎
開講日
2025-06-17
到達目標・学習方法・内容
タンパク質の立体構造解析におけるNMR法の役割や重要性を理解し、説明できる。
No. 10
講義項目
クライオ電子顕微鏡法を用いたタンパク質の立体構造解析の概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
安達 成彦
開講日
2025-06-24
到達目標・学習方法・内容
タンパク質の立体構造解析におけるクライオ電子顕微鏡法の役割や重要性を理解し、説明できる。
No. 11
講義項目
In silico Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
田中 信忠
開講日
2025-07-01
到達目標・学習方法・内容
In silico Drug Design全般に関して要点を説明できる。
No. 12
講義項目
Ligand-Based Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
中込 泉
開講日
2025-07-08
到達目標・学習方法・内容
Ligand-Based Drug Designについて要点を説明できる。
No. 13
講義項目
Structure-Based Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
吉田 智喜
開講日
2025-07-15
到達目標・学習方法・内容
Structure-Based Drug Designについて要点を説明できる。
No. 14
講義項目
Fragment-Based Drug Design概説
※教室変更:1507セミナー室
担当者
小澤 新一郎
開講日
2025-07-22
到達目標・学習方法・内容
Fragment-Based Drug Designについて要点を説明できる。
No. 15
講義項目
Structure-Based Drug Designのまとめ
※教室変更:1507セミナー室
担当者
山乙 教之
開講日
2025-07-29
到達目標・学習方法・内容
Structure-Based Drug Designの実例を理解できる。

評価方法

定期試験 
授業 
その他履修態度、講義内容に関連した課題レポート(100%)により評価します。
無断欠席・遅刻・早退などは減点対象となります。

学生へのメッセージ

積極的な態度で講義に臨んでください。
わからない点があれば、質問してください。

準備学習(予習・復習)・その他

1【授業時間外に必要な学習の時間:60時間】
2【予習】シラバスを用いて、講義内容の確認を行ってください。前回までの講義内容を理解しておいてください。
【復習】配付資料などを用いて、講義内容を復習してください。

教材

種別書名著者・編者発行所
教科書(なし) 
参考書分子モデリング概説A.R.リーチ著 江崎俊之訳地人書館
教科書
署名
(なし)
著者・編者
 
発行所
参考書
署名
分子モデリング概説
著者・編者
A.R.リーチ著 江崎俊之訳
発行所
地人書館